Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRBNQ96SW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms