Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCLRE1CQ96SD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms