Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CICQ96RK0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CICQ96RK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms