Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGLYRP2Q96PD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms