Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIC6Q96NY7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLIC6Q96NY7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms