Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RUNDC3BQ96NL0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms