Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD6Q96NE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD6Q96NE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD6Q96NE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms