Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC17Q96LX7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms