Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM47Q96LD4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM47Q96LD4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms