Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA3Q96KX2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms