Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms