Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A4AQ96JQ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms