Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCHS1Q96JQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms