Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms