Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX3Q96JJ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms