Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CRELD1Q96HD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms