Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC12Q96GR4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC12Q96GR4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC12Q96GR4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms