Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF2Q96GP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms