Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALML4Q96GE6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML4Q96GE6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML4Q96GE6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms