Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX3

WDR34, WD repeat-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR34Q96EX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR34Q96EX3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR34Q96EX3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR34Q96EX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms