Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM19Q96E16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms