Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCTD12Q96CX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms