Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OPTNQ96CV9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms