Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPRTQ96BW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms