Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms