Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD2Q969F2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms