Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GATA6Q92908 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms