Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms