Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCAF4Q8WV16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms