Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms