Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC2Q8TF65 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC2Q8TF65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC2Q8TF65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GIPC2Q8TF65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC2Q8TF65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms