Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBASH3BQ8TF42 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBASH3BQ8TF42 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3BQ8TF42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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