Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRSK1Q8TDC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms