Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYRIPQ8NFW9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms