Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP43Q8NFH3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms