Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A4Q8NFF2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC24A4Q8NFF2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms