Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF397Q8NF99 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms