Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF1Q8NEP3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF1Q8NEP3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms