Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM83FQ8NEG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM83FQ8NEG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms