Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC42

RNF149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149Q8NC42 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF149Q8NC42 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF149Q8NC42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms