Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2AQ8NA29 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD2AQ8NA29 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms