Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIPA2Q8N8Q9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPA2Q8N8Q9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms