Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G2

VGLL2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL2Q8N8G2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VGLL2Q8N8G2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGLL2Q8N8G2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL2Q8N8G2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms