Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms