Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1Q8N0S2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms