Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D3Q8IZS8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms