Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC105Q8IYK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC105Q8IYK2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC105Q8IYK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC105Q8IYK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC105Q8IYK2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC105Q8IYK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms