Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPAP2Q8IXW5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPAP2Q8IXW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms