Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT12Q8IV01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms