Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC49Q8IUZ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms